Pulmonary inflammation and viral replication define distinct clinical outcomes in fatal cases of COVID-19

• Keyla S. G. de Sá,

  Roles Conceptualization, Data curation, Formal analysis, Investigation, Methodology, Validation, Visualization, Writing – original draft

  Current address: Department of Immunobiology, Yale School of Medicine, New Haven, Connecticut, United States of America

  Affiliation Departamento de Biologia Celular e Molecular e Bioagentes Patogênicos, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil

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• Luana A. Amaral,

  Roles Conceptualization, Data curation, Investigation, Writing – review & editing

  Affiliation Departamento de Biologia Celular e Molecular e Bioagentes Patogênicos, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Tamara S. Rodrigues,

  Roles Formal analysis, Investigation, Writing – review & editing

  Affiliation Departamento de Biologia Celular e Molecular e Bioagentes Patogênicos, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil

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• Camila C. S. Caetano,

  Roles Investigation, Writing – review & editing

  Affiliation Departamento de Biologia Celular e Molecular e Bioagentes Patogênicos, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Amanda Becerra,

  Roles Investigation, Writing – review & editing

  Affiliation Departamento de Biologia Celular e Molecular e Bioagentes Patogênicos, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil

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• Sabrina S. Batah,

  Roles Investigation, Writing – review & editing

  Affiliation Departamento de Patologia e Medicina Legal, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil

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• Felipe T. Lopes,

  Roles Investigation, Writing – review & editing

  Affiliation Departamento de Biologia Celular e Molecular e Bioagentes Patogênicos, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Isadora M. de Oliveira,

  Roles Investigation, Writing – review & editing

  Affiliation Departamento de Biologia Celular e Molecular e Bioagentes Patogênicos, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Letícia S. Lopes,

  Roles Investigation, Writing – review & editing

  Affiliation Departamento de Biologia Celular e Molecular e Bioagentes Patogênicos, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Leticia Almeida,

  Roles Investigation, Writing – review & editing

  Affiliation Departamento de Biologia Celular e Molecular e Bioagentes Patogênicos, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil

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• Caroline M. Mota,

  Roles Investigation, Writing – review & editing

  Affiliation Departamento de Biologia Celular e Molecular e Bioagentes Patogênicos, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Samuel Oliveira,

  Roles Investigation, Writing – review & editing

  Affiliation Departamento de Biologia Celular e Molecular e Bioagentes Patogênicos, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil

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• Danilo T. Wada,

  Roles Investigation, Writing – review & editing

  Affiliation Departamento de Imagens Médicas, Hematologia e Oncologia, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil

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• Marcel Koenigkam-Santos,

  Roles Investigation, Writing – review & editing

  Affiliation Departamento de Imagens Médicas, Hematologia e Oncologia, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil

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• Ronaldo B. Martins,

  Roles Investigation, Writing – review & editing

  Affiliation Departamento de Biologia Celular e Molecular e Bioagentes Patogênicos, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil

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• Roberta R. C. Rosales,

  Roles Investigation, Writing – review & editing

  Affiliation Departamento de Biologia Celular e Molecular e Bioagentes Patogênicos, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil

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• Eurico Arruda,

  Roles Conceptualization, Writing – review & editing

  Affiliation Departamento de Biologia Celular e Molecular e Bioagentes Patogênicos, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil

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• Alexandre T. Fabro,

  Roles Conceptualization, Investigation, Methodology, Resources, Writing – review & editing

  Affiliation Departamento de Patologia e Medicina Legal, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil

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•  [ ... ],
• Dario S. Zamboni

  Roles Conceptualization, Data curation, Funding acquisition, Methodology, Project administration, Resources, Supervision, Visualization, Writing – original draft

  * E-mail: dszamboni@fmrp.usp.br

  Affiliation Departamento de Biologia Celular e Molecular e Bioagentes Patogênicos, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil

  https://orcid.org/0000-0002-7856-7512

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