About the Authors

Guillaume Gautreau

Roles Data curation, Formal analysis, Investigation, Methodology, Software, Visualization, Writing – original draft, Writing – review & editing

Affiliation LABGeM, Génomique Métabolique, CEA, Genoscope, Institut François Jacob, Université d’Évry, Université Paris-Saclay, CNRS, Evry, France

Adelme Bazin

Roles Data curation, Formal analysis, Investigation, Software, Writing – original draft, Writing – review & editing

Affiliation LABGeM, Génomique Métabolique, CEA, Genoscope, Institut François Jacob, Université d’Évry, Université Paris-Saclay, CNRS, Evry, France

Mathieu Gachet

Roles Data curation

Affiliation LABGeM, Génomique Métabolique, CEA, Genoscope, Institut François Jacob, Université d’Évry, Université Paris-Saclay, CNRS, Evry, France

Rémi Planel

Roles Data curation

Current address: Hub de Bioinformatique et Biostatistique - Département Biologie Computationnelle, Institut Pasteur, USR 3756 CNRS, Paris, France

Affiliation LABGeM, Génomique Métabolique, CEA, Genoscope, Institut François Jacob, Université d’Évry, Université Paris-Saclay, CNRS, Evry, France

Laura Burlot

Roles Data curation

Affiliation LABGeM, Génomique Métabolique, CEA, Genoscope, Institut François Jacob, Université d’Évry, Université Paris-Saclay, CNRS, Evry, France

Mathieu Dubois

Roles Data curation, Writing – review & editing

Affiliation LABGeM, Génomique Métabolique, CEA, Genoscope, Institut François Jacob, Université d’Évry, Université Paris-Saclay, CNRS, Evry, France

Amandine Perrin

Roles Data curation

Affiliations Microbial Evolutionary Genomics, Institut Pasteur, CNRS, UMR3525, Paris, France, Sorbonne Université, Collège doctoral, Paris, France

Claudine Médigue

Roles Writing – review & editing

Affiliation LABGeM, Génomique Métabolique, CEA, Genoscope, Institut François Jacob, Université d’Évry, Université Paris-Saclay, CNRS, Evry, France

Alexandra Calteau

Roles Writing – review & editing

Affiliation LABGeM, Génomique Métabolique, CEA, Genoscope, Institut François Jacob, Université d’Évry, Université Paris-Saclay, CNRS, Evry, France

Stéphane Cruveiller

Roles Writing – review & editing

Current address: PathoQuest SAS, BioPark – bâtiment B, 11 rue Watt, 75013 Paris, France

Affiliation LABGeM, Génomique Métabolique, CEA, Genoscope, Institut François Jacob, Université d’Évry, Université Paris-Saclay, CNRS, Evry, France

Catherine Matias

Roles Methodology, Writing – review & editing

Affiliation Laboratoire de Probabilités, Statistique et Modélisation, Sorbonne Université, Université de Paris, Centre National de la Recherche Scientifique, Paris, France

Christophe Ambroise

Roles Methodology, Writing – review & editing

Affiliation Laboratoire de Mathématiques et Modélisation d’Evry, UMR CNRS 8071, Université d’Evry Val d’Essonne, Evry, France

Eduardo P. C. Rocha

Roles Writing – original draft, Writing – review & editing

Affiliation Microbial Evolutionary Genomics, Institut Pasteur, CNRS, UMR3525, Paris, France

David Vallenet

Roles Conceptualization, Supervision, Writing – original draft, Writing – review & editing

vallenet@genoscope.cns.fr

Affiliation LABGeM, Génomique Métabolique, CEA, Genoscope, Institut François Jacob, Université d’Évry, Université Paris-Saclay, CNRS, Evry, France

Competing Interests

The authors have declared that no competing interests exist.