Cryptic circulation of chikungunya virus in São Jose do Rio Preto, Brazil, 2015–2019

• Nathalia Zini,

  Roles Conceptualization, Data curation, Formal analysis, Investigation, Methodology, Project administration, Validation, Writing – original draft, Writing – review & editing

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Matheus Henrique Tavares Ávila,

  Roles Data curation, Formal analysis, Investigation, Methodology

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Natalia Morbi Cezarotti,

  Roles Data curation, Formal analysis, Investigation, Methodology

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Maisa Carla Pereira Parra,

  Roles Data curation, Formal analysis, Investigation, Methodology

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Cecília Artico Banho,

  Roles Data curation, Writing – original draft

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Livia Sacchetto,

  Roles Data curation, Formal analysis, Methodology, Writing – original draft

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Andreia Francesli Negri,

  Roles Investigation

  Affiliation Vigilância Epidemiológica, Secretaria de Saúde de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

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• Emerson Araújo,

  Roles Methodology

  Affiliation Department of Strategic Coordination of Health Surveillance, Secretary of Health Surveillance, Brazilian Ministry of Health, Rio de Janeiro, Brazil

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• Cintia Bittar,

  Roles Formal analysis

  Affiliation Laboratório de Estudos Genômicos, Instituto de Biociências, Letras & Ciências Exatas, Universidade Estadual Paulista, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

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• Bruno Henrique Gonçalves de Aguiar Milhin,

  Roles Formal analysis, Investigation, Methodology

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Victor Miranda Hernandes,

  Roles Formal analysis, Investigation, Methodology

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Karina Rocha Dutra,

  Roles Formal analysis, Investigation, Methodology

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Leonardo Agopian Trigo,

  Roles Formal analysis, Investigation, Methodology

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Leonardo Cecílio da Rocha,

  Roles Formal analysis, Investigation, Methodology

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Rafael Alves da Silva,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

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• Gislaine Celestino Dutra da Silva,

  Roles Investigation, Project administration

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Tamires Fernanda Pereira dos Santos,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Beatriz de Carvalho Marques,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Andresa Lopes dos Santos,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Marcos Tayar Augusto,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Natalia Franco Bueno Mistrão,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Milene Rocha Ribeiro,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Tauyne Menegaldo Pinheiro,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Thayza Maria Izabel Lopes dos Santos,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Clarita Maria Secco Avilla,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Estudos Genômicos, Instituto de Biociências, Letras & Ciências Exatas, Universidade Estadual Paulista, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Victoria Bernardi,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Caroline Freitas,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Flora de Andrade Gandolfi,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

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• Hélio Correa Ferraz Júnior,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

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• Gabriela Camilotti Perim,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  ⨯
• Mirella Cezare Gomes,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

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• Pedro Henrique Carrilho Garcia,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

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• Rodrigo Sborghi Rocha,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

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• Tayna Manfrin Galvão,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

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• Eliane Aparecida Fávaro,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

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• Samuel Noah Scamardi,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

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• Karen Sanmartin Rogovski,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

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• Renan Luiz Peixoto,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

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• Luiza Benfatti,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Investigação de Microrganismos, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

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• Leonardo Teixeira Cruz,

  Roles Investigation

  Affiliation Universidade Federal da Grande Dourados, Dourados, Mato Grosso do Sul, Brazil

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• Paula Patricia de Freitas Chama,

  Roles Investigation

  Affiliation Centro Integrado de Pesquisa Hospital de Base, FUNFARME, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

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• Mânlio Tasso Oliveira,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Retrovirologia, Departamento de Medicina, Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil

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• Aripuanã Sakurada Aranha Watanabe,

  Roles Investigation

  Affiliation Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Parasitologia e Microbiologia, Universidade Federal de Juiz de Fora, Juiz de Fora, Minas Gerais, Brazil

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• Ana Carolina Bernardes Terzian,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Imunologia Celular e Molecular, Instituto René Rachou, Fundação Osvaldo Cruz, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil

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• Alice de Freitas Versiani,

  Roles Data curation, Investigation

  Affiliation Department of Pathology, University of Texas Medical Branch, Galveston, Texas, United States of America

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• Margareth Regina Dibo,

  Roles Investigation

  Affiliation Laboratório de Entomologia, Superintendência de Controle de Endemias, São Paulo, Brazil

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• Francisco Chiaravalotti-Neto,

  Roles Methodology

  Affiliation Departamento de Epidemiologia, Faculdade de Saúde Pública, Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil

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• Scott Cameron Weaver,

  Roles Conceptualization, Writing – review & editing

  Affiliations Department of Microbiology & Immunology, University of Texas Medical Branch, Galveston, Texas, United States of America, Center for Biodefense and Emerging Infectious Diseases, University of Texas Medical Branch, Galveston, Texas, United States of America, Center for Tropical Diseases, University of Texas Medical Branch, Galveston, Texas, United States of America, Institute for Human Infections and Immunity, University of Texas Medical Branch, Galveston, Texas, United States of America

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• Cassia Fernanda Estofolete,

  Roles Conceptualization, Data curation, Investigation, Project administration, Writing – original draft, Writing – review & editing

  Affiliations Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil, Hospital de Base, FUNFARME, São José Do Rio Preto, São Paulo, Brazil

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• Nikos Vasilakis,

  Roles Conceptualization, Funding acquisition, Methodology, Project administration, Supervision, Writing – review & editing

  Affiliations Department of Pathology, University of Texas Medical Branch, Galveston, Texas, United States of America, Center for Biodefense and Emerging Infectious Diseases, University of Texas Medical Branch, Galveston, Texas, United States of America, Center for Tropical Diseases, University of Texas Medical Branch, Galveston, Texas, United States of America, Institute for Human Infections and Immunity, University of Texas Medical Branch, Galveston, Texas, United States of America, Center for Vector-Borne and Zoonotic Diseases, University of Texas Medical Branch, Galveston, Texas, United States of America

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•  [ ... ],
• Mauricio Lacerda Nogueira

  Roles Conceptualization, Data curation, Funding acquisition, Investigation, Methodology, Project administration, Supervision, Writing – original draft, Writing – review & editing

  * E-mail: mauricio.nogueira@edu.famerp.br

  Affiliations Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil, Department of Pathology, University of Texas Medical Branch, Galveston, Texas, United States of America, Hospital de Base, FUNFARME, São José Do Rio Preto, São Paulo, Brazil

  https://orcid.org/0000-0003-1102-2419

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