Individual co-variation between viral RNA load and gene expression reveals novel host factors during early dengue virus infection of the Aedes aegypti midgut

• Vincent Raquin,

  Roles Conceptualization, Formal analysis, Investigation, Methodology, Visualization, Writing – original draft

  Current address: Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon, Ecole Normale Supérieure de Lyon, Centre National de la Recherche Scientifique, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, Cedex, France

  Affiliations Insect-Virus Interactions Group, Department of Genomes and Genetics, Institut Pasteur, Paris, France, Centre National de la Recherche Scientifique, Unité de Recherche Associée 3012, Paris, France

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• Sarah Hélène Merkling,

  Roles Investigation, Writing – review & editing

  Affiliations Insect-Virus Interactions Group, Department of Genomes and Genetics, Institut Pasteur, Paris, France, Centre National de la Recherche Scientifique, Unité de Recherche Associée 3012, Paris, France

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• Valérie Gausson,

  Roles Investigation, Methodology

  Affiliations Viruses and RNA Interference Unit, Department of Virology, Institut Pasteur, Paris, France, Centre National de la Recherche Scientifique, Unité Mixte de Recherche 3569, Paris, France

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• Isabelle Moltini-Conclois,

  Roles Investigation

  Affiliations Insect-Virus Interactions Group, Department of Genomes and Genetics, Institut Pasteur, Paris, France, Centre National de la Recherche Scientifique, Unité de Recherche Associée 3012, Paris, France

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• Lionel Frangeul,

  Roles Data curation, Formal analysis, Writing – review & editing

  Affiliations Viruses and RNA Interference Unit, Department of Virology, Institut Pasteur, Paris, France, Centre National de la Recherche Scientifique, Unité Mixte de Recherche 3569, Paris, France

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• Hugo Varet,

  Roles Data curation, Formal analysis, Methodology, Writing – review & editing

  Affiliations Plate-forme Transcriptome & Epigenome, Biomics, Centre d’Innovation et Recherche Technologique (Citech), Institut Pasteur, Paris, France, Hub Bioinformatique & Biostatistique, Centre de Bioinformatique, Biostatistique et Biologie Intégrative (C3BI), Institut Pasteur, Paris, France, Centre National de la Recherche Scientifique, Unité de Services et de Recherches 3756, Institut Pasteur, Paris, France

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• Marie-Agnès Dillies,

  Roles Data curation, Formal analysis, Methodology, Writing – review & editing

  Affiliations Plate-forme Transcriptome & Epigenome, Biomics, Centre d’Innovation et Recherche Technologique (Citech), Institut Pasteur, Paris, France, Hub Bioinformatique & Biostatistique, Centre de Bioinformatique, Biostatistique et Biologie Intégrative (C3BI), Institut Pasteur, Paris, France, Centre National de la Recherche Scientifique, Unité de Services et de Recherches 3756, Institut Pasteur, Paris, France

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• Maria-Carla Saleh ,

  Roles Conceptualization, Funding acquisition, Supervision, Writing – original draft

  * E-mail: louis.lambrechts@pasteur.fr (LL); carla.saleh@pasteur.fr (MCS)

  Affiliations Viruses and RNA Interference Unit, Department of Virology, Institut Pasteur, Paris, France, Centre National de la Recherche Scientifique, Unité Mixte de Recherche 3569, Paris, France

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• Louis Lambrechts

  Roles Conceptualization, Formal analysis, Funding acquisition, Supervision, Writing – original draft

  * E-mail: louis.lambrechts@pasteur.fr (LL); carla.saleh@pasteur.fr (MCS)

  Affiliations Insect-Virus Interactions Group, Department of Genomes and Genetics, Institut Pasteur, Paris, France, Centre National de la Recherche Scientifique, Unité de Recherche Associée 3012, Paris, France

  http://orcid.org/0000-0001-5958-2138

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