Genetic structure of traditional cacao reveals four new genetic lineages in indigenous Amazonian sites in Peru

• Lambert A. Motilal ,

  Contributed equally to this work with: Lambert A. Motilal, Martha S. Calderon, Danilo E. Bustamante

  Roles Conceptualization, Formal analysis, Investigation, Writing – original draft, Writing – review & editing

  Affiliation Cocoa Research Centre, The University of the West Indies, St. Augustine, Trinidad, Trinidad and Tobago

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• Martha S. Calderon ,

  Contributed equally to this work with: Lambert A. Motilal, Martha S. Calderon, Danilo E. Bustamante

  Roles Conceptualization, Data curation, Formal analysis, Investigation, Methodology, Validation, Writing – original draft, Writing – review & editing

  Affiliations Instituto de Investigación para el Desarrollo Sustentable de Ceja de Selva (INDES-CES), Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza, Chachapoyas, Peru, Instituto de Investigación en Ingeniería Ambiental (INAM), Facultad de Ingeniería Ambiental, Biosistemas y de la Energía (FIABE), Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza, Chachapoyas, Peru

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• Danilo E. Bustamante ,

  Contributed equally to this work with: Lambert A. Motilal, Martha S. Calderon, Danilo E. Bustamante

  Roles Conceptualization, Data curation, Formal analysis, Funding acquisition, Investigation, Project administration, Supervision, Writing – original draft, Writing – review & editing

  * E-mail: danilo.bustamante@untrm.edu.pe

  Affiliations Instituto de Investigación para el Desarrollo Sustentable de Ceja de Selva (INDES-CES), Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza, Chachapoyas, Peru, Instituto de Investigación en Ingeniería Ambiental (INAM), Facultad de Ingeniería Ambiental, Biosistemas y de la Energía (FIABE), Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza, Chachapoyas, Peru

  https://orcid.org/0000-0002-5979-6993

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• David Gopaulchan,

  Roles Data curation, Formal analysis, Investigation, Writing – original draft

  Affiliation School of Biosciences, University of Nottingham, Nottingham, United Kingdom

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• Daniel Tineo,

  Roles Conceptualization, Data curation, Resources, Writing – original draft

  Affiliation Centro Experimental Yanayacu, Dirección de Servicios Estratégicos Agrarios (DSEA), Instituto Nacional de Innovación Agraria (INIA), Jaén, Peru

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• Fanny R. Márquez-Romero,

  Roles Data curation, Validation, Writing – original draft

  Affiliation Departamento académico de Ingeniería Agronómica Tropical, Universidad Nacional Intercultural de Quillabamba, Cusco, Peru

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• Sphyros Lastra,

  Roles Data curation, Methodology, Resources

  Affiliation Estación Experimental Agraria Perla del VRAEM, Dirección de Recursos Genéticos y Biotecnología, Instituto Nacional de Innovación Agraria (INIA), Cusco, Perú

  https://orcid.org/0000-0001-9017-0852

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• Jorge R. Diaz-Valderrama,

  Roles Conceptualization, Data curation, Methodology

  Affiliation Instituto de Investigación para el Desarrollo Sustentable de Ceja de Selva (INDES-CES), Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza, Chachapoyas, Peru

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• Juan Carlos Guerrero-Abad,

  Roles Conceptualization, Data curation, Validation, Visualization

  Affiliation Instituto de Investigación, Innovación y Desarrollo para el Sector Agrario y Agroindustrial (IIDAA), Facultad de Ingeniería y Ciencias Agrarias (FICA), Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, Chachapoyas, Peru

  https://orcid.org/0000-0002-7285-9506

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• Manuel Oliva,

  Roles Conceptualization, Funding acquisition, Project administration, Supervision, Visualization

  Affiliation Instituto de Investigación para el Desarrollo Sustentable de Ceja de Selva (INDES-CES), Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza, Chachapoyas, Peru

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• Pathmanathan Umaharan

  Roles Conceptualization, Resources, Supervision, Writing – original draft

  Affiliation Cocoa Research Centre, The University of the West Indies, St. Augustine, Trinidad, Trinidad and Tobago

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