Environmental DNA illuminates the darkness of mesophotic assemblages of fishes from West Indian Ocean

• Emmanuel Corse ,

  Contributed equally to this work with: Emmanuel Corse, Marie Gimenez

  Roles Formal analysis, Investigation, Methodology, Writing – original draft, Writing – review & editing

  Affiliations Université de Mayotte, Mayotte, France, MARBEC, Université Montpellier, CNRS, IFREMER, IRD, Montpellier, France

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• Marie Gimenez ,

  Contributed equally to this work with: Emmanuel Corse, Marie Gimenez

  Roles Formal analysis, Methodology, Writing – original draft, Writing – review & editing

  * E-mail: mariegimenez34@yahoo.fr

  Affiliations Université de Mayotte, Mayotte, France, Centre de Recherche sur la Biodiversité et l’Environnement (CRBE), Université de Toulouse, CNRS, IRD, Toulouse INP, Université Toulouse 3 – Paul Sabatier (UT3), Toulouse, France

  https://orcid.org/0009-0008-7048-5193

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• Estelle Crochelet,

  Roles Conceptualization, Investigation, Project administration, Writing – review & editing

  Affiliation Agence de Recherche pour la Biodiversité à La Réunion (ARBRE), Saint-Denis, Réunion, France

  ⨯
• Anaïs Paulin-Fayolle,

  Roles Formal analysis, Methodology, Resources

  Affiliation Agence de Recherche pour la Biodiversité à La Réunion (ARBRE), Saint-Denis, Réunion, France

  ⨯
• Florian Campagnari,

  Roles Investigation, Resources, Writing – review & editing

  Affiliation Agence de Recherche pour la Biodiversité à La Réunion (ARBRE), Saint-Denis, Réunion, France

  ⨯
• Océane Desbonnes,

  Roles Writing – review & editing

  Affiliation Agence de Recherche pour la Biodiversité à La Réunion (ARBRE), Saint-Denis, Réunion, France

  ⨯
• Léo Broudic,

  Roles Writing – review & editing

  Affiliations Agence de Recherche pour la Biodiversité à La Réunion (ARBRE), Saint-Denis, Réunion, France, Vie Océane, La Réunion, France

  ⨯
• Patrick Durville,

  Roles Writing – review & editing

  Affiliations GALAXEA, La Réunion, France, Deep Blue Exploration, Mayotte, France

  ⨯
• Florence Trentin,

  Roles Writing – review & editing

  Affiliation Vie Océane, La Réunion, France

  ⨯
• Gabriel Barathieu,

  Roles Investigation, Methodology, Writing – review & editing

  Affiliation Deep Blue Exploration, Mayotte, France

  ⨯
• Clément Delamare,

  Roles Investigation, Methodology, Writing – review & editing

  Affiliation Service de Plongée Scientifique, Mayotte, France

  ⨯
• Thomas Gautier,

  Roles Investigation, Methodology, Writing – review & editing

  Affiliation Deep Blue Exploration, Mayotte, France

  ⨯
• Camille Loisil,

  Roles Investigation, Methodology, Writing – review & editing

  Affiliation Poisson Lune, La Réunion, France

  ⨯
• Patrick Plantard,

  Roles Investigation, Methodology, Writing – review & editing

  Affiliation Poisson Lune, La Réunion, France

  ⨯
• Sébastien Quaglietti,

  Roles Investigation, Methodology, Writing – review & editing

  Affiliations Service de Plongée Scientifique, Mayotte, France, Parc Naturel Marin de Mayotte, Pamandzi, Mayotte, France

  ⨯
• Thierry Mulochau ,

  Roles Funding acquisition, Investigation, Project administration

  ¶‡ TM and NN also contributed equally to this work.

  Affiliations Agence de Recherche pour la Biodiversité à La Réunion (ARBRE), Saint-Denis, Réunion, France, BIORECIF, La Réunion, France

  ⨯
•  [ ... ],
• Natacha Nikolic

  Roles Conceptualization, Formal analysis, Methodology, Supervision, Writing – original draft, Writing – review & editing

  ¶‡ TM and NN also contributed equally to this work.

  Affiliations Centre de Recherche sur la Biodiversité et l’Environnement (CRBE), Université de Toulouse, CNRS, IRD, Toulouse INP, Université Toulouse 3 – Paul Sabatier (UT3), Toulouse, France, Agence de Recherche pour la Biodiversité à La Réunion (ARBRE), Saint-Denis, Réunion, France, INRAE, AQUA, ECOBIOP, Toulouse, France

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