Phylogenomic analysis and Mycobacterium tuberculosis antibiotic resistance prediction by whole-genome sequencing from clinical isolates of Caldas, Colombia

• Lusayda Sánchez-Corrales,

  Roles Conceptualization, Formal analysis, Investigation, Project administration, Writing – original draft

  Affiliation Maestría en Investigación en Enfermedades Infecciosas, Universidad de Santander, Bucaramanga, Santander, Colombia

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• Olga Lucía Tovar-Aguirre,

  Roles Conceptualization, Formal analysis, Project administration, Writing – original draft

  Affiliation Programa de Bacteriología, Universidad Católica de Manizales, Manizales, Caldas, Colombia

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• Narmer Fernando Galeano-Vanegas,

  Roles Conceptualization, Data curation, Formal analysis, Methodology, Software, Writing – review & editing

  Affiliations Instituto de Investigación en Microbiología y Biotecnología Agroindustrial, Universidad Católica de Manizales, Manizales, Caldas, Colombia, Departamento de Biotecnología, BIOS Centro de Bioinformática y Biología Computacional, Manizales, Caldas, Colombia

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• Paula Alejandra Castaño Jiménez,

  Roles Formal analysis, Investigation, Methodology

  Affiliation Programa de Bacteriología, Universidad Católica de Manizales, Manizales, Caldas, Colombia

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• Ruth Arali Martínez-Vega,

  Roles Funding acquisition, Resources, Validation

  Affiliation Facultad de Salud, Universidad de Santander, Bucaramanga, Santander, Colombia

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• Carlos Ernesto Maldonado-Londoño,

  Roles Data curation, Formal analysis, Software

  Affiliation Centro Nacional de Investigaciones de Café –Cenicafé, Manizales, Caldas, Colombia

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• Johan Sebastián Hernández-Botero,

  Roles Conceptualization, Data curation, Formal analysis, Funding acquisition, Software, Validation, Writing – review & editing

  Affiliations Grupo de Investigación Médica, Escuela de Medicina, Universidad de Manizales, Manizales, Caldas, Colombia, Grupo de Resistencia Antibiótica de Manizales, Manizales, Caldas, Colombia

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• Fernando Siller-López

  Roles Conceptualization, Investigation, Project administration, Supervision, Writing – review & editing

  * E-mail: fsiller@ucm.edu.co

  Affiliations Programa de Bacteriología, Universidad Católica de Manizales, Manizales, Caldas, Colombia, Programa de Microbiología, Universidad Libre, Pereira, Risaralda, Colombia

  https://orcid.org/0000-0003-4542-4985

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