Evaluation of different analysis pipelines for the detection of HIV-1 minority resistant variants

• Marine Perrier,

  Roles Data curation, Methodology, Validation, Writing – review & editing

  Affiliation IAME, UMR 1137, INSERM, Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, AP-HP, Laboratoire de Virologie, Hôpital Bichat, AP-HP, Paris, France

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• Nathalie Désiré,

  Roles Data curation, Formal analysis, Methodology, Writing – original draft, Writing – review & editing

  Affiliations Sorbonne University, UPMC Univ Paris 06, INSERM, Institut Pierre Louis d'épidémiologie et de Santé Publique (IPLESP UMRS 1136), Paris, France, Hôpital Pitié Salpêtrière, Laboratoire de Virologie, Paris, France

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• Alexandre Storto,

  Roles Data curation, Methodology, Validation

  Affiliation IAME, UMR 1137, INSERM, Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, AP-HP, Laboratoire de Virologie, Hôpital Bichat, AP-HP, Paris, France

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• Eve Todesco,

  Roles Data curation, Formal analysis, Validation, Writing – review & editing

  Affiliations Sorbonne University, UPMC Univ Paris 06, INSERM, Institut Pierre Louis d'épidémiologie et de Santé Publique (IPLESP UMRS 1136), Paris, France, Hôpital Pitié Salpêtrière, Laboratoire de Virologie, Paris, France

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• Christophe Rodriguez,

  Roles Conceptualization, Methodology, Writing – review & editing

  Affiliations Département de Microbiologie, Next-Generation Sequencing Platform pACT, IMRB Créteil, Créteil, France, Institut Mondor de Recherche Biomédicale U955, Créteil, France

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• Mélanie Bertine,

  Roles Data curation, Formal analysis, Validation, Writing – review & editing

  Affiliation IAME, UMR 1137, INSERM, Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, AP-HP, Laboratoire de Virologie, Hôpital Bichat, AP-HP, Paris, France

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• Quentin Le Hingrat,

  Roles Data curation, Writing – review & editing

  Affiliation IAME, UMR 1137, INSERM, Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, AP-HP, Laboratoire de Virologie, Hôpital Bichat, AP-HP, Paris, France

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• Benoit Visseaux,

  Roles Data curation

  Affiliation IAME, UMR 1137, INSERM, Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, AP-HP, Laboratoire de Virologie, Hôpital Bichat, AP-HP, Paris, France

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• Vincent Calvez,

  Roles Conceptualization, Formal analysis, Validation, Writing – review & editing

  Affiliations Sorbonne University, UPMC Univ Paris 06, INSERM, Institut Pierre Louis d'épidémiologie et de Santé Publique (IPLESP UMRS 1136), Paris, France, Hôpital Pitié Salpêtrière, Laboratoire de Virologie, Paris, France

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• Diane Descamps,

  Roles Conceptualization, Writing – review & editing

  Affiliation IAME, UMR 1137, INSERM, Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, AP-HP, Laboratoire de Virologie, Hôpital Bichat, AP-HP, Paris, France

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• Anne-Geneviève Marcelin,

  Roles Conceptualization, Formal analysis, Validation, Writing – review & editing

  Affiliations Sorbonne University, UPMC Univ Paris 06, INSERM, Institut Pierre Louis d'épidémiologie et de Santé Publique (IPLESP UMRS 1136), Paris, France, Hôpital Pitié Salpêtrière, Laboratoire de Virologie, Paris, France

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• Charlotte Charpentier

  Roles Conceptualization, Methodology, Validation, Writing – original draft

  * E-mail: charlotte.charpentier@aphp.fr

  Affiliation IAME, UMR 1137, INSERM, Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, AP-HP, Laboratoire de Virologie, Hôpital Bichat, AP-HP, Paris, France

  http://orcid.org/0000-0002-6441-7054

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