Introducing automation to the molecular diagnosis of Trypanosoma cruzi infection: A comparative study of sample treatments, DNA extraction methods and real-time PCR assays

• Alba Abras ,

  Contributed equally to this work with: Alba Abras, Cristina Ballart

  Roles Conceptualization, Data curation, Formal analysis, Investigation, Methodology, Software, Validation, Visualization, Writing – original draft, Writing – review & editing

  Affiliations Secció de Parasitologia, Departament de Biologia, Sanitat i Medi Ambient, Facultat de Farmàcia i Ciències de l’Alimentació, Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain, ISGlobal, Barcelona Centre for International Health Research (CRESIB), Hospital Clínic–Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain, Laboratori d’Ictiologia Genètica, Departament de Biologia, Universitat de Girona, Girona, Spain

  ⨯
• Cristina Ballart ,

  Contributed equally to this work with: Alba Abras, Cristina Ballart

  Roles Conceptualization, Data curation, Formal analysis, Investigation, Methodology, Software, Validation, Visualization, Writing – original draft, Writing – review & editing

  Affiliations Secció de Parasitologia, Departament de Biologia, Sanitat i Medi Ambient, Facultat de Farmàcia i Ciències de l’Alimentació, Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain, ISGlobal, Barcelona Centre for International Health Research (CRESIB), Hospital Clínic–Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain

  ⨯
• Teresa Llovet,

  Roles Resources

  Affiliations Servei de Microbiologia, Hospital de la Santa Creu i Sant Pau, Barcelona, Spain, Departament de Genètica i Microbiologia, Universitat Autònoma de Barcelona, Cerdanyola del Vallès, Spain

  ⨯
• Carme Roig,

  Roles Resources

  Affiliation Servei de Microbiologia, Hospital de la Santa Creu i Sant Pau, Barcelona, Spain

  ⨯
• Cristina Gutiérrez,

  Roles Resources

  Affiliation Servei de Microbiologia, Hospital de la Santa Creu i Sant Pau, Barcelona, Spain

  ⨯
• Silvia Tebar,

  Roles Resources

  Affiliations Secció de Parasitologia, Departament de Biologia, Sanitat i Medi Ambient, Facultat de Farmàcia i Ciències de l’Alimentació, Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain, ISGlobal, Barcelona Centre for International Health Research (CRESIB), Hospital Clínic–Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain

  ⨯
• Pere Berenguer,

  Roles Resources

  Affiliation Servei de Microbiologia, Hospital de la Santa Creu i Sant Pau, Barcelona, Spain

  ⨯
• María-Jesús Pinazo,

  Roles Resources, Writing – review & editing

  Affiliation ISGlobal, Barcelona Centre for International Health Research (CRESIB), Hospital Clínic–Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain

  ⨯
• Elizabeth Posada,

  Roles Resources

  Affiliation ISGlobal, Barcelona Centre for International Health Research (CRESIB), Hospital Clínic–Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain

  ⨯
• Joaquim Gascón,

  Roles Funding acquisition, Resources, Writing – review & editing

  Affiliation ISGlobal, Barcelona Centre for International Health Research (CRESIB), Hospital Clínic–Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain

  ⨯
• Alejandro G. Schijman,

  Roles Resources, Writing – review & editing

  Affiliation Laboratorio de Biología Molecular de la Enfermedad de Chagas (LaBMECh), Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular “Dr. Héctor N. Torres” (INGEBI-CONICET), Buenos Aires, Argentina

  ⨯
• Montserrat Gállego ,

  Roles Conceptualization, Funding acquisition, Methodology, Project administration, Resources, Supervision, Visualization, Writing – original draft, Writing – review & editing

  * E-mail: mgallego@ub.edu (MG); cmunoz@santpau.cat (CM)

  Affiliations Secció de Parasitologia, Departament de Biologia, Sanitat i Medi Ambient, Facultat de Farmàcia i Ciències de l’Alimentació, Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain, ISGlobal, Barcelona Centre for International Health Research (CRESIB), Hospital Clínic–Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain

  http://orcid.org/0000-0002-8143-9773

  ⨯
• Carmen Muñoz

  Roles Conceptualization, Funding acquisition, Methodology, Project administration, Resources, Supervision, Visualization, Writing – original draft, Writing – review & editing

  * E-mail: mgallego@ub.edu (MG); cmunoz@santpau.cat (CM)

  Affiliations Servei de Microbiologia, Hospital de la Santa Creu i Sant Pau, Barcelona, Spain, Departament de Genètica i Microbiologia, Universitat Autònoma de Barcelona, Cerdanyola del Vallès, Spain, Institut d’Investigació Biomèdica Sant Pau (IIB Sant Pau), Hospital de la Santa Creu i Sant Pau, Barcelona, Spain

  ⨯