Fast and Robust Characterization of Time-Heterogeneous Sequence Evolutionary Processes Using Substitution Mapping

• Jonathan Romiguier ,

  * E-mail: jonathan.romiguier@univ-montp2.fr

  Affiliation Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier, CNRS-Université Montpellier 2, Montpellier, France

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• Emeric Figuet,

  Affiliation Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier, CNRS-Université Montpellier 2, Montpellier, France

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• Nicolas Galtier,

  Affiliation Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier, CNRS-Université Montpellier 2, Montpellier, France

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• Emmanuel J. P. Douzery,

  Affiliation Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier, CNRS-Université Montpellier 2, Montpellier, France

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• Bastien Boussau,

  Affiliations Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive, CNRS-Université Lyon 1, Villeurbanne, France, Department of Integrative Biology, University of California, Berkeley, California, United States of America

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• Julien Y. Dutheil ,

  Contributed equally to this work with: Julien Y. Dutheil, Vincent Ranwez

  Affiliation Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier, CNRS-Université Montpellier 2, Montpellier, France

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• Vincent Ranwez

  Contributed equally to this work with: Julien Y. Dutheil, Vincent Ranwez

  Affiliations Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier, CNRS-Université Montpellier 2, Montpellier, France, Unité Mixte de Recherche Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales, Montpellier SupAgro, Montpellier, France

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