S4 appendix. Distances calculated from the order of protein-coding and ribosomal RNA mitochondrial (mt) genes with the program Genome_Comparison.c considering transposition, inversion and reverse transposition events. Gain/loss events have been added a posteriori. [ 1] #Tethya_actinia [ 2] #Xenoturbella_bocki [ 3] #Balanoglossus_carnosus [ 4] #Antedon_mediterranea [ 5] #Gymnocrinus_richeri [ 6] #Florometra_serratissima [ 7] #Asterina_pectinifera [ 8] #Ophiura_lukteni [ 9] #Ophiopholis_aculeata [10] #Strongylocentrotus_purpuratus [11] #Asymmetron_inferum [12] #Phallusia_fumigata [13] #Phallusia_mammillata [14] #Ciona_savignyi [15] #Ciona_intestinalis [16] #Halocynthia_roretzi [17] #Doliolum_nationalis [18] #Homo_sapiens [19] #Caenorhabditis_elegans [20] #Trichinella_spiralis [21] #Priapulus_caudatus [22] #Epiperipatus_biolleyi [23] #Limulus_polyphemus [24] #Nymphon_gracile [25] #Steganacarus_magnus [26] #Dermatophagoides_pteronyssinus [27] #Ligia_oceanica [28] #Argulus_americanus [29] #Speleonectes_tulumensis [30] #Narceus_annularis [31] #Tigriopus_japonicus [32] #Vargula_hilgendorfii [33] #Eriocheir_sinensis [34] #Chinkia_crosnieri [35] #Megabalanus_volcano [36] #Cherax_destructor [37] #Pagurus_longicarpus [38] #Katharina_tunicata [39] #Paraspadella_gotoi [40] #Spadella_cephaloptera [41] #Sagitta_enflata [42] #Sagitta_nagae [43] #Gyrodactylus_derjavenoides [44] #Schistosoma_mansoni [45] #Platynereis_dumerilii [46] #Urechis_caupo [47] #Sipunculus_nudus [48] #Phoronis_architecta [49] #Loxocorone_allax [50] #Laqueus_rubellus [51] #Leptorhynchoides_thecatus [52] #Nautilus_macromphallus [53] #Loligo_bleekeri [54] #Biomphalaria_glabrata [55] #Graptacme_eborea [56] #Cepeae_nemoralis [57] #Siphonodentalium_lobatum [58] #Mytilus_edulis [59] #Venerupis_philippinarum [60] #Lampsilis_ornata [61] #Inversidens_japanensis [62] #Albinaria_soerulea [63] #Flustrellidra_hispida [64] #Bugula_neritina [65] #Watersipora_subtorquata [66] #Leptotrombidium_akamushi [67] #Lingula_anatina [68] #Terebratulina_retusa [69] #Terebratalia_transversa [ 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 ] [ 1] [ 2] 5.000 [ 3] 5.000 1.000 [ 4] 6.000 4.000 4.000 [ 5] 7.000 4.000 4.000 1.000 [ 6] 6.000 4.000 4.000 1.000 1.000 [ 7] 6.000 3.000 3.000 2.000 2.000 1.000 [ 8] 5.000 3.000 3.000 3.000 3.000 2.000 2.000 [ 9] 5.000 3.000 3.000 3.000 3.000 2.000 1.000 1.000 [10] 6.000 3.000 3.000 2.000 2.000 1.000 1.000 2.000 2.000 [11] 6.000 3.000 3.000 5.000 4.000 5.000 4.000 4.000 4.000 4.000 [12] 7.000 6.000 6.000 7.000 6.000 6.000 7.000 6.000 6.000 6.000 6.000 [13] 8.000 6.000 6.000 6.000 6.000 6.000 6.000 6.000 6.000 6.000 5.000 6.000 [14] 8.000 7.000 7.000 7.000 6.000 7.000 7.000 6.000 6.000 7.000 7.000 5.000 5.000 [15] 8.000 7.000 7.000 6.000 6.000 6.000 7.000 7.000 7.000 7.000 7.000 5.000 6.000 1.000 [16] 8.000 7.000 7.000 7.000 7.000 7.000 7.000 7.000 7.000 7.000 6.000 7.000 7.000 6.000 6.000 [17] 7.000 7.000 7.000 7.000 6.000 6.000 6.000 6.000 6.000 6.000 7.000 7.000 6.000 6.000 6.000 6.000 [18] 5.000 1.000 1.000 3.000 3.000 3.000 2.000 3.000 2.000 2.000 2.000 6.000 6.000 7.000 7.000 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Exact minimal distances matrix calculated with genome_comparison.c program. The distances represent the minimal number of intrachromosal recombination of the protein-coding and rRNA genes, e.g., transposition, inversion, reverse transposition and gain/loss, necessary to go from one mitochondrial genomic organisation to another. In the case of a gain/loss event of one gene, the calculated distances have been increased a posteriori by 1. In the case of a gain/loss event of two genes, the distances have been increased by 2 except when the gain/loss event concerned a block of two successive genes (case of chaetognaths, loss of block atp8/atp6, distance increased by 1).