About the Authors

Laurence Pages-Monteiro

Affiliations Equipe de Recherche, Bactéries Pathogènes Opportunistes et Environnement, UMR CNRS 5557 Ecologie Microbienne, Université Lyon 1 & VetAgro Sup, Villeurbanne, France, Laboratoire de Bactériologie, Centre de Biologie et Pathologie Est, Hospices Civils de Lyon (HCL), Bron, France

Romain Marti

Affiliation Equipe de Recherche, Bactéries Pathogènes Opportunistes et Environnement, UMR CNRS 5557 Ecologie Microbienne, Université Lyon 1 & VetAgro Sup, Villeurbanne, France

Carine Commun

Affiliation Equipe de Recherche, Bactéries Pathogènes Opportunistes et Environnement, UMR CNRS 5557 Ecologie Microbienne, Université Lyon 1 & VetAgro Sup, Villeurbanne, France

Nolwenn Alliot

Affiliation Equipe de Recherche, Bactéries Pathogènes Opportunistes et Environnement, UMR CNRS 5557 Ecologie Microbienne, Université Lyon 1 & VetAgro Sup, Villeurbanne, France

Claire Bardel

Affiliation Equipe de recherche, UMR CNRS 5558, INRA, INRIA, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive, Université Lyon 1 & ISPB, Lyon, France

Helene Meugnier

Affiliation CIRI, International Center for Infectiology Research, INSERM U1111, CNRS UMR5308, Université de Lyon, Ecole Normale Supérieure de Lyon, France

Michele Perouse-de-Montclos

Affiliations Laboratoire de Bactériologie, Centre hospitalier Lyon Sud, Hospices Civils de Lyon, Saint-Genis-Laval, France, Centre de Ressources et de Compétences (CRCM) adulte, Centre Hospitalier Lyon Sud, Hospices Civils de Lyon, Pierre Bénite France, France

Philippe Reix

Affiliation Centre de ressources et Compétences (CRCM) enfant, Hôpital Femme Mère Enfant, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France

Isabelle Durieu

Affiliation Centre de Ressources et de Compétences (CRCM) adulte, Centre Hospitalier Lyon Sud, Hospices Civils de Lyon, Pierre Bénite France, France

Stephane Durupt

Affiliation Centre de Ressources et de Compétences (CRCM) adulte, Centre Hospitalier Lyon Sud, Hospices Civils de Lyon, Pierre Bénite France, France

Francois Vandenesch

Affiliations Laboratoire de Bactériologie, Centre de Biologie et Pathologie Est, Hospices Civils de Lyon (HCL), Bron, France, Equipe de recherche Pathogénie des Staphylocoques, INSERM U851, Bron, France

Jean Freney

Affiliations Equipe de Recherche, Bactéries Pathogènes Opportunistes et Environnement, UMR CNRS 5557 Ecologie Microbienne, Université Lyon 1 & VetAgro Sup, Villeurbanne, France, Laboratoire de Bactériologie, Centre de Biologie et Pathologie Est, Hospices Civils de Lyon (HCL), Bron, France

Benoit Cournoyer

Affiliation Equipe de Recherche, Bactéries Pathogènes Opportunistes et Environnement, UMR CNRS 5557 Ecologie Microbienne, Université Lyon 1 & VetAgro Sup, Villeurbanne, France

Anne Doleans-Jordheim

anne.doleans-jordheim@univ-lyon1.fr

Affiliations Equipe de Recherche, Bactéries Pathogènes Opportunistes et Environnement, UMR CNRS 5557 Ecologie Microbienne, Université Lyon 1 & VetAgro Sup, Villeurbanne, France, Laboratoire de Bactériologie, Centre de Biologie et Pathologie Est, Hospices Civils de Lyon (HCL), Bron, France

Competing Interests

The authors have declared that no competing interests exist.

Author Contributions

Conceptualization: ADJ BC RM LPM CC. Data curation: LPM RM. Formal analysis: RM BC NA CB LPM. Funding acquisition: LPM BC ADJ. Investigation: LPM CC. Methodology: ADJ BC RM LPM CC. Project administration: ADJ BC CC LPM. Resources: MPM BC PR ID SD FV JF. Software: RM NA CB HM. Supervision: ADJ. Validation: LPM CC. Visualization: LPM RM ADJ. Writing – original draft: LPM BC ADJ. Writing – review & editing: LPM RM NA BC ADJ.