About the Authors

Isabelle Schuffenecker

To whom correspondence should be addressed. E-mail: schuffenecker@cervi-lyon.inserm.fr (IS); E-mail: sbrisse@pasteur.fr (SB)

Affiliation Centre National de Référence des Arbovirus, Institut Pasteur, Lyon, France

Isabelle Iteman

Affiliation Plate-forme Génotypage des Pathogènes et Santé Publique (PF8), Institut Pasteur, Paris, France

Alain Michault

Affiliation Laboratoire de Microbiologie, Hôpital St Pierre, St Pierre, Ile de la Réunion, France

Séverine Murri

Affiliation Centre National de Référence des Arbovirus, Institut Pasteur, Lyon, France

Lionel Frangeul

Affiliation Plate-forme Intégration et Analyse Génomique, Institut Pasteur, Paris, France

Marie-Christine Vaney

Affiliations Unité de Virologie Structurale, Institut Pasteur, Paris, France , Centre National de la Recherche Scientifique/Institut National de la Recherche Agronomique UMR 2472/1157, Paris, France

Rachel Lavenir

Affiliation Plate-forme Génotypage des Pathogènes et Santé Publique (PF8), Institut Pasteur, Paris, France

Nathalie Pardigon

Affiliation Unité des Interactions Moléculaires Flavivirus-Hôtes, Institut Pasteur, Paris, France

Jean-Marc Reynes

Affiliation Unité de Virologie, Institut Pasteur, Antananarivo, Madagascar

François Pettinelli

Affiliation Laboratoire de Biologie Médicale, Centre Hospitalier de Mayotte, Mamoudzou, Mayotte, France

Leon Biscornet

Affiliation Disease Surveillance and Sexually Transmitted Infections Unit, Seychelles Public Health Laboratory, Ministry of Health and Social Services, Victoria, Mahe, Seychelles

Laure Diancourt

Affiliation Plate-forme Génotypage des Pathogènes et Santé Publique (PF8), Institut Pasteur, Paris, France

Stéphanie Michel

Affiliation Centre National de Référence des Arbovirus, Institut Pasteur, Lyon, France

Stéphane Duquerroy

Affiliations Unité de Virologie Structurale, Institut Pasteur, Paris, France , Centre National de la Recherche Scientifique/Institut National de la Recherche Agronomique UMR 2472/1157, Paris, France , Université Paris, XI-Orsay, Paris, France

Ghislaine Guigon

Affiliation Plate-forme Génotypage des Pathogènes et Santé Publique (PF8), Institut Pasteur, Paris, France

Marie-Pascale Frenkiel

Affiliation Unité des Interactions Moléculaires Flavivirus-Hôtes, Institut Pasteur, Paris, France

Anne-Claire Bréhin

Affiliation Unité des Interactions Moléculaires Flavivirus-Hôtes, Institut Pasteur, Paris, France

Nadège Cubito

Affiliation Centre National de Référence des Arbovirus, Institut Pasteur, Lyon, France

Philippe Desprès

Affiliation Unité des Interactions Moléculaires Flavivirus-Hôtes, Institut Pasteur, Paris, France

Frank Kunst

Affiliation Unité de Génomique des Microorganismes Pathogènes and Centre National de la Recherche Scientifique URA 2171, Institut Pasteur, Paris, France

Félix A Rey

Affiliations Unité de Virologie Structurale, Institut Pasteur, Paris, France , Centre National de la Recherche Scientifique URA 1930, Paris, France

Hervé Zeller

Affiliation Centre National de Référence des Arbovirus, Institut Pasteur, Lyon, France

Sylvain Brisse

To whom correspondence should be addressed. E-mail: schuffenecker@cervi-lyon.inserm.fr (IS); E-mail: sbrisse@pasteur.fr (SB)

Affiliation Plate-forme Génotypage des Pathogènes et Santé Publique (PF8), Institut Pasteur, Paris, France

Competing Interests

The authors have declared that no competing interests exist.

Author Contributions

AM, JMR, FP, and LB sent biological samples for virus isolation and sequencing. SM, SM and NC isolated virus strains, performed RT-PCRs and viral RNA extractions from biological specimens and virus isolates and LF designed and synthesized the primers. II, RL, and LD performed RT-PCRs and sequence reactions. II, LF, GG, and SB assembled the genome sequence. IS, II, LF, MCV, SD, FAR, and SB analyzed sequence data. MPF, ACB, and PD contributed to the production of CHIKV stocks and performed immunofluorescence analysis and viral RNA extraction. NP, MPF, and PD performed focus immunoassays. IS, PD, FK, FAR, HZ, and SB wrote the manuscript.