About the Authors

Daniel Muller

Affiliation Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, UMR7156 CNRS and Université Louis Pasteur, Strasbourg, France

Claudine Médigue

Affiliation Génoscope, UMR8030 CNRS, Evry Cedex, France

Sandrine Koechler

Affiliation Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, UMR7156 CNRS and Université Louis Pasteur, Strasbourg, France

Valérie Barbe

Affiliation Génoscope, UMR8030 CNRS, Evry Cedex, France

Mohamed Barakat

Affiliation Laboratoire d'Écologie Microbienne de la Rhizosphère et d'Environnements Extrêmes, UMR6191 CNRS, CEA and Université Aix-Marseille II, Saint-Paul-lez-Durance, France

Emmanuel Talla

Affiliation Laboratoire de Chimie Bactérienne, UPR9043 CNRS, Institut de Biologie Structurale et Microbiologie, Marseille, France

Violaine Bonnefoy

Affiliation Laboratoire de Chimie Bactérienne, UPR9043 CNRS, Institut de Biologie Structurale et Microbiologie, Marseille, France

Evelyne Krin

Affiliation Génétique des Génomes Bactériens, URA2171, Institut Pasteur, Paris, France

Florence Arsène-Ploetze

Affiliation Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, UMR7156 CNRS and Université Louis Pasteur, Strasbourg, France

Christine Carapito

Affiliation Laboratoire de Spectrométrie de Masse Bio-Organique, Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien, UMR7178 CNRS and Université Louis Pasteur, Strasbourg, France

Michael Chandler

Affiliation Laboratoire de Microbiologie et Génétique Moléculaires, UMR5100 CNRS, Toulouse, France

Benoît Cournoyer

Affiliation Ecologie Microbienne, UMR5557 CNRS and Université Claude Bernard–Lyon 1, Villeurbanne, France

Stéphane Cruveiller

Affiliation Génoscope, UMR8030 CNRS, Evry Cedex, France

Caroline Dossat

Affiliation Génoscope, UMR8030 CNRS, Evry Cedex, France

Simon Duval

Affiliation Laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des Protéines, UPR9036 CNRS, Institut de Biologie Structurale et Microbiologie, Marseille, France

Michael Heymann

Affiliation Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, UMR7156 CNRS and Université Louis Pasteur, Strasbourg, France

Emmanuelle Leize

Affiliation Laboratoire de Spectrométrie de Masse Bio-Organique, Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien, UMR7178 CNRS and Université Louis Pasteur, Strasbourg, France

Aurélie Lieutaud

Affiliation Laboratoire de Chimie Bactérienne, UPR9043 CNRS, Institut de Biologie Structurale et Microbiologie, Marseille, France

Didier Lièvremont

Affiliation Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, UMR7156 CNRS and Université Louis Pasteur, Strasbourg, France

Yuko Makita

Affiliation Génétique des Génomes Bactériens, URA2171, Institut Pasteur, Paris, France

Sophie Mangenot

Affiliation Génoscope, UMR8030 CNRS, Evry Cedex, France

Wolfgang Nitschke

Affiliation Laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des Protéines, UPR9036 CNRS, Institut de Biologie Structurale et Microbiologie, Marseille, France

Philippe Ortet

Affiliation Laboratoire d'Écologie Microbienne de la Rhizosphère et d'Environnements Extrêmes, UMR6191 CNRS, CEA and Université Aix-Marseille II, Saint-Paul-lez-Durance, France

Nicolas Perdrial

Affiliation Centre de Géochimie de la Surface, UMR7517 CNRS and Université Louis Pasteur, Strasbourg, France

Barbara Schoepp

Affiliation Laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des Protéines, UPR9036 CNRS, Institut de Biologie Structurale et Microbiologie, Marseille, France

Patricia Siguier

Affiliation Laboratoire de Microbiologie et Génétique Moléculaires, UMR5100 CNRS, Toulouse, France

Diliana D Simeonova

Affiliation Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, UMR7156 CNRS and Université Louis Pasteur, Strasbourg, France

Zoé Rouy

Affiliation Génoscope, UMR8030 CNRS, Evry Cedex, France

Béatrice Segurens

Affiliation Génoscope, UMR8030 CNRS, Evry Cedex, France

Evelyne Turlin

Affiliation Génétique des Génomes Bactériens, URA2171, Institut Pasteur, Paris, France

David Vallenet

Affiliation Génoscope, UMR8030 CNRS, Evry Cedex, France

Alain Van Dorsselaer

Affiliation Laboratoire de Spectrométrie de Masse Bio-Organique, Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien, UMR7178 CNRS and Université Louis Pasteur, Strasbourg, France

Stéphanie Weiss

Affiliation Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, UMR7156 CNRS and Université Louis Pasteur, Strasbourg, France

Jean Weissenbach

Affiliation Génoscope, UMR8030 CNRS, Evry Cedex, France

Marie-Claire Lett

Affiliation Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, UMR7156 CNRS and Université Louis Pasteur, Strasbourg, France

Antoine Danchin

Affiliation Génétique des Génomes Bactériens, URA2171, Institut Pasteur, Paris, France

Philippe N Bertin

To whom correspondence should be addressed. E-mail: philippe.bertin@gem.u-strasbg.fr

Affiliation Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, UMR7156 CNRS and Université Louis Pasteur, Strasbourg, France

Competing Interests

The authors have declared that no competing interests exist.

Author Contributions

DM contributed to genome annotation and data analysis and to the writing of the manuscript, and performed genetic and molecular biology experiments. CM contributed to genome annotation and to the writing of the manuscript, and coordinated software development for genome analysis (MaGe). SK and SW contributed to genome annotation and data analysis, and to physiology experiments. VB, CD, SM, BS, and JW performed the sequencing and finishing of the genome. MB, ET, VB, EK, and PO contributed to genome annotation and data analysis. WN analyzed the data. SC, ZR, and DV contributed to the automatic and manual annotation, to the analysis of genome information and to MaGe development. FAP, CC, EL, ET, and AVD contributed to proteomic data analysis. MH contributed to genome annotation and proteomic data analysis, and to the development of InPact web interface. AL contributed to genome annotation. DL contributed to genome annotation and electron microscopy experiments. YM contributed to software development. MC, SD, PS, and BS contributed to genome data analysis. BC, DDS, and NP contributed to physiology, biochemistry or biophysics experiments. MCL initiated the experimental work on H. arsenicoxydans and contributed to genome annotation. AD contributed to genome annotation and data analysis and to the writing of the manuscript. PNB coordinated the project, contributed to the analysis of genome information, and wrote the manuscript.